2016年10月，王某入職某公司，崗位是保安。雙方簽訂了書面勞動合同，工作時間為做一休一，具體工作時間為早上8點至次日早上8點。同時雙方在合同中約定，晚上22點至次日凌晨5點王某可以在保安亭的休息設施內睡眠休息。2017年4月，王某以個人原因辭職，并要求公司支付2016年10月至2017年4月的加班工資，包括工作日延長工作時間的150%的加班工資、休息日200%的加班工資以及法定節假日300%的加班工資。
    對此，公司提出異議，認為王某系實行綜合計算工時工作制的員工，公司無需支付加班工資。2017年5月，王某申請勞動仲裁。

    適用綜合計算工時工作制的勞動者加班工資如何計算？

    雙方就加班工資的支付達成調解協議。

    綜合計算工時工作制是指因工作性質特殊或者受季節及自然條件限制，需在一段時間內連續作業，采取以周、月、季、年等為周期綜合計算工作時間的一種工時制度，其周期內平均工作時間應與法定標準工作時間基本相同。同時實行綜合計算工時工作制的崗位，需用人單位報經屬地勞動保障行政部門批準。

    本案中，該公司提供了王某所在崗位的綜合計算工時行政許可決定書，其實行期限為2016年9月1日至2017年8月31日，結算周期為一個月。通過雙方均認可的王某的考勤記錄、工資支付憑證，并扣除王某可以睡眠休息的時間，該公司確實存在某些月份實際工作時間超過法定標準工作時間以及法定節假日安排工作的情況，公司應根據相關標準支付王某加班工資，經釋明后，雙方就加班工資達成一致協議。
    另，用人單位在實踐中應注意綜合計算工時行政許可決定的審批的有效期和審批人數，在有效期限屆滿前，及時進行續批。同時，如果勞動者存在加班事實，用人單位應及時足額支付加班工資。